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石垣岛海上保安部是日本海上保安厅最西端、也是最南端的机构，主要负责琉球群岛南部的八重山列岛海域的执法行动。由于该部距离中国钓鱼岛最近，是直接“管理”钓鱼岛海域的日本行政机构，也是中国在保卫钓鱼岛主权时第一个需要直接面对的对手。

该部门主要任务包括管理非法捕鱼行为，监视进入该海域的外国调查船等船只，对海上事故进行预防和搜救，而最重要的任务就是监视并阻止中国大陆、台湾、香港等地的保钓行动。

石垣岛海上保安部拥有第11管区内数量最多的船只，其中本部直辖的船只有大型巡视船2艘，小型巡视船2艘，巡视艇2艘，监视取缔艇1艘，灯塔运补船1艘，另外该部管辖的宫古岛海上保安署拥有小型巡视船1艘及巡视艇1艘。另外本部还拥有两架固定翼飞机和两架直升机。（2010年9月15日）

责任编辑：李颖